Mee ohtlikus võib avalduda allergia näol, mille põhjustajaks mees oleva õietolm ja muud mees olevad ühendid.

Mõned meetaimed annavad mürgist nektarit. Näiteks.

– Mõned rododendroni liigid

– Eestis sookail ja lood-angervars

Mees võib esineda bakteri Clostridium botulinum endospoore, mida seostatakse nn imiku botulismiga;

bakteri poolt toodetavat mürki botuliini pole mees kunagi leitud

• Mesi pole steriilne, kuid kvaliteetses küpsenud mees mikroorganismid ei arene; osmofiilsed pärmid võivad areneda ja põhjustada mee käärimist soojas hoidmisel

mee suurenenud niiskuse korral.